Ang Colegio de San Juan de Letrán ay nagsimula sa pagtawag sa kanilang sarili na "Colegio para mestizos" at nilikha noong 1548, sa pagkusa ng mga peninsular na Espanyol na nakakita ng pagdaragdag sa bilang ng mga mestiso na ipinanganak sa New Spain na nangangailangan ng edukasyon.
Ang Colegio de San Juan de Letrán ay nagsimula sa pagtawag sa kanilang sarili na "Colegio para mestizos" at nilikha noong 1548, sa pagkusa ng mga peninsular na Espanyol na nakakita ng pagtaas sa bilang ng mga mestiso na ipinanganak sa New Spain na nangangailangan ng edukasyon.
Upang matagpuan ang institusyong ito, hindi sila humingi ng pahintulot kay Viceroy Antonio de Mendoza, ngunit sa halip ay nagpadala ng isang kinatawan sa Espanya upang makakuha ng pahintulot mula sa hari, at si Don Gregorio de la Pesquera ay itinalaga para sa nasabing misyon. Ang taong namamahala ay nakakuha ng Royal Certificate ng pahintulot na inisyu noong Agosto 18, 1548. Sa pagsisimula nito, ang Kolehiyo ay nakakuha ng laro ng 600 libong piso mula sa pagmimina, pribadong kontribusyon at limos.
Pinamunuan siya ng tatlong pari: isang rektor at dalawang konsehal, ang rektor ay maaaring tumagal ng isang taon sa kanyang puwesto at pagkatapos ang dalawa ay maaaring sakupin ang rektoryo. Ang pagbabasa, ang doktrinang Kristiyano ay itinuro, at pagkatapos ang mga mas advanced na mag-aaral ay hinimok na pumunta sa kolehiyo.
Ang paaralan ay tumanggi sa pagtatapos ng ika-18 siglo, nakaligtas ito hanggang sa Kalayaan at noong 1821 nakatanggap ito ng malaking tulong ngunit nawala ito nang tuluyan noong 1857. Matatagpuan ito sa matandang Calle de San Juan de Letrán sa pagitan ng kasalukuyang Calle Venustiano Carranza at Madero sa daanan na Nakaharap ito sa silangan sa harap ng kumbento ng San Francisco na sumakop sa buong kalye.
