Ang kasaysayan ng lungsod na orihinal na tinawag na Kaharian ng New Galicia ay nagpatuloy.
Mayroon ding matandang kolehiyo ng Heswita ng Santo Tomás de Aquino, na itinayo noong huling dekada ng ika-16 na siglo at kung saan noong 1792 ay sinakop ng Unibersidad. Sa konstruksyon, ano lamang ang simbahan, na may malaking simboryo nito mula noong huling siglo, at ang nakakabit na Loreto chapel, na itinayo noong 1695 ni Juan María de Salvatierra, ay nananatili. Ang templo ng San Juan de Dios, na dating Chapel ng Santa Veracruz, na itinayo noong ika-16 na siglo ni Don Pedro Gómez Maraver, ay itinayo noong ika-18 siglo na may isang baroque façade ng matino na mga katangian. Ang simbahan ng La Merced, na may istilong baroque na katulad ng San Juan de Dios, kahit na higit na gayak, ay itinatag noong ika-17 siglo ng mga prayle na sina Miguel Telmo at Miguel de Albuquerque.
Ang Templo ng La Soledad ay itinayo sa pagtatapos ng ika-17 at unang bahagi ng ika-18 siglo sa kahilingan ni Juana Romana de Torres at ng kanyang asawang si Kapitan Juan Bautista Panduro. Sa lugar na iyon ay ang kapatiran ng Our Lady of Solitude at ang Holy Sepulcher, na sumasakop sa isang kapilya na nakatuon kay San Francisco Xavier. Ang templo at paaralan ng San Diego, gawain ng siglo XVII; ang una ay may isang napaka matino na harapan na tila nabibilang sa neoclassical na istilo at ang pangalawa ay may isang magandang arcade na pinalamutian ang luma nitong lagay.
Ang simbahan ng Jesús María, na nakakabit sa kumbento ng parehong pangalan, ay itinatag noong 1722; pinapanatili pa rin nito ang mga facade ng Baroque, kung saan makikita mo ang malalaking eskultura na kumakatawan sa Sagrada Familia, ang Virgen de la Luz, San Francisco at Santo Domingo.
Sa wakas, mahalagang i-highlight ang tatlong higit pang mga konstruksyon sa relihiyon na lumitaw bilang pinakamahusay na mga halimbawa, bawat isa sa uri nito, ng pag-unlad ng kolonyal na arkitektura sa Guadalajara, higit sa lahat sa pagitan ng ikalabimpito at labing walong siglo. Sa gayon mayroon kaming Aránzazu chapel, mula sa kalagitnaan ng ika-18 siglo, na may mausisa na belfry at ang panloob na pinalamutian ng mga nakamamanghang kuwadro na gawa at Churrigueresque altarpieces mula sa parehong panahon at isinasaalang-alang ang pinakamahusay sa lungsod. Ang kumbento at simbahan ng Santa Mónica, itinatag ni Padre Feliciano Pimentel noong unang kalahati ng ika-18 siglo; ang templo nito ay nagpapakita ng isang dobleng harapan na may mayamang gayak na nakalista bilang pinakamahusay na halimbawa ng masiglang istilong Solomononic Baroque. Ang templo ng San Felipe Neri, na itinayo noong 1766 ng arkitekto na si Pedro Ciprés, ay bumubuo ng isang hanay ng pambihirang paghinahon na nagsasama ng mga elemento na may mga nakapagpapaalaala sa Plateresque sa kanyang gayak, isang aspeto na naglalagay ng templo bilang pinakamahusay na gusali ng relihiyon sa Guadalajara.
Sa mga konstruksyon na tumutugma sa arkitekturang sibil, mayroong ilang mga kahanga-hanga na gusali, bukod dito maaari nating banggitin ang Palasyo ng Pamahalaan, mga lumang bahay-hari na binago noong ika-18 siglo kasunod ng isang proyekto ng inhinyero ng militar na si Juan Francisco Espino, bagaman ang harapan ay gawain ni Miguel José Conique. Ang gusali ay ipinaglihi sa mahalagang istilo ng Baroque, ngunit ang ilang mga neoclassical tendency ay kapansin-pansin na rito. Ang mga tanggapan ng hari, na nasa nawala na Palacio de Medrano, at ang courtrooms ay gumagana sa mga lugar.
Mayroon din kaming kung ano ang pamilyar na Seminary Seminary na nakatuon kay San José, na pinasinayaan ni Bishop Galindo y Chávez noong 1701, na sinakop ngayon ng Regional Museum ng Guadalajara, kasama ang pangunahing lagayan ng mga haligi ng estilo ng Tuscan at mga pintuan ng Baroque. Ang bantog na Hospicio Cabañas ay itinayo noong simula ng ika-19 na siglo, kasunod ng mga plano ng bantog na arkitekto na si Manuel Tolsá, na nagdidirek ng akdang José Gutiérrez at nakumpleto ang mga taon pagkaraan ng arkitektong Gómez Ibarra, at kung saan ay bumubuo ng isang pambihirang halimbawa ng neoclassical style.
Kabilang sa iba pang mga menor de edad na konstruksyon na nagbigay ng pang-istilong pagkakaisa sa lungsod ng Guadalajara, maaari nating banggitin, kahit na hindi lahat ay napanatili: ang marangal na mansyon ng ika-16 na siglo na nakatayo sa harap ng dating parisukat ng San Sebastián sa kapitbahayan ng Analco. Ang bahay sa Calle de la Alhóndiga No. 114, kasalukuyang Pino Suárez. Ang mga tirahan na pagmamay-ari ng pamilyang Sánchez Leñero sa numero 37 at ng G. Dionisio Rodríguez sa No. 133 sa Calle de Alcalde. Ang bahay ng Calderón, isang tradisyonal na kolonyal na tindahan ng kendi na itinatag noong 1729 at matatagpuan sa sulok ng mga lumang kalye ng Santa Teresa at Santuario, ngayon Morelos at Pedro Loza; na ni Francisco Velarde, sa isang neoclassical style, at sa wakas ang isa na ang mansyon ng Cañedo, na matatagpuan sa harap ng likuran ng Cathedral.
Sa paligid ng Guadalajara, ang pangatlong pinakamahalagang lungsod sa bansa, ay ang matandang bayan ng San Juan Bautista Melzquititlán, ngayon ay San Juan de los Lagos. Ang bayang ito ay naging isang mahalagang relihiyosong sentro dahil sa dakilang milagrosong tradisyon ng imahe ng Birheng Maria na pinapanatili ang basilica nito, na itinayo noong kalagitnaan ng ika-17 siglo ni Don Juan Rodríguez Estrada. Sa parehong bayan maaari mong makita ang iba pang mga konstruksyon tulad ng Temple of the Third Order, the Chapel of Calvary, the Chapel of the First Miracle, mula pa noong ika-17 at ika-18 na siglo. Mayroon ding mga mahahalagang gusaling sibil sa populasyon, tulad ng Palasyo ng Kolehiyo at ang pagbuo ng mga Ikapu, bukod sa iba pa.
Sa bayan ng Lagos de Moreno makikita mo ang pangunahing parokya, isang gawaing ika-17 siglo na may magandang harapan ng istilong Churrigueresque.
Sa wakas, sa San Pedro Tlaquepaque mayroong ilang mga halimbawa ng arkitekturang relihiyosong Baroque sa rehiyon, tulad ng parokya ng San Pedro at ang Templo ng Soledad.
